Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyp4f39Q8BGU0 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms