Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGJ9

U2af1l4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1l4Q8BGJ9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
U2af1l4Q8BGJ9 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
U2af1l4Q8BGJ9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
U2af1l4Q8BGJ9 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
U2af1l4Q8BGJ9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
U2af1l4Q8BGJ9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
U2af1l4Q8BGJ9 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
U2af1l4Q8BGJ9 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
U2af1l4Q8BGJ9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
U2af1l4Q8BGJ9 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
U2af1l4Q8BGJ9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
U2af1l4Q8BGJ9 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
U2af1l4Q8BGJ9 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
U2af1l4Q8BGJ9 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
U2af1l4Q8BGJ9 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
U2af1l4Q8BGJ9 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
U2af1l4Q8BGJ9 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
U2af1l4Q8BGJ9 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
U2af1l4Q8BGJ9 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
U2af1l4Q8BGJ9 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
U2af1l4Q8BGJ9 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
U2af1l4Q8BGJ9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
U2af1l4Q8BGJ9 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
U2af1l4Q8BGJ9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
U2af1l4Q8BGJ9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
U2af1l4Q8BGJ9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
U2af1l4Q8BGJ9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
U2af1l4Q8BGJ9 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
U2af1l4Q8BGJ9 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
U2af1l4Q8BGJ9 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
U2af1l4Q8BGJ9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
U2af1l4Q8BGJ9 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
U2af1l4Q8BGJ9 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
U2af1l4Q8BGJ9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
U2af1l4Q8BGJ9 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
U2af1l4Q8BGJ9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
U2af1l4Q8BGJ9 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
U2af1l4Q8BGJ9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
U2af1l4Q8BGJ9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
U2af1l4Q8BGJ9 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
U2af1l4Q8BGJ9 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
U2af1l4Q8BGJ9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
U2af1l4Q8BGJ9 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
U2af1l4Q8BGJ9 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
U2af1l4Q8BGJ9 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
U2af1l4Q8BGJ9 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
U2af1l4Q8BGJ9 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
U2af1l4Q8BGJ9 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
U2af1l4Q8BGJ9 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
U2af1l4Q8BGJ9 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms