Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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