Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG18

Necab1, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necab1Q8BG18 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Necab1Q8BG18 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Necab1Q8BG18 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Necab1Q8BG18 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Necab1Q8BG18 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Necab1Q8BG18 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Necab1Q8BG18 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Necab1Q8BG18 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Necab1Q8BG18 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Necab1Q8BG18 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Necab1Q8BG18 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Necab1Q8BG18 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Necab1Q8BG18 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Necab1Q8BG18 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Necab1Q8BG18 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Necab1Q8BG18 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Necab1Q8BG18 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Necab1Q8BG18 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Necab1Q8BG18 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Necab1Q8BG18 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Necab1Q8BG18 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Necab1Q8BG18 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Necab1Q8BG18 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Necab1Q8BG18 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Necab1Q8BG18 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Necab1Q8BG18 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Necab1Q8BG18 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Necab1Q8BG18 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Necab1Q8BG18 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Necab1Q8BG18 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Necab1Q8BG18 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Necab1Q8BG18 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Necab1Q8BG18 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Necab1Q8BG18 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Necab1Q8BG18 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Necab1Q8BG18 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Necab1Q8BG18 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Necab1Q8BG18 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Necab1Q8BG18 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Necab1Q8BG18 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Necab1Q8BG18 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Necab1Q8BG18 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Necab1Q8BG18 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Necab1Q8BG18 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Necab1Q8BG18 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Necab1Q8BG18 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Necab1Q8BG18 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Necab1Q8BG18 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Necab1Q8BG18 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Necab1Q8BG18 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Necab1Q8BG18 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Necab1Q8BG18 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Necab1Q8BG18 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Necab1Q8BG18 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Necab1Q8BG18 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Necab1Q8BG18 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Necab1Q8BG18 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Necab1Q8BG18 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Necab1Q8BG18 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Necab1Q8BG18 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Necab1Q8BG18 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Necab1Q8BG18 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Necab1Q8BG18 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Necab1Q8BG18 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Necab1Q8BG18 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Necab1Q8BG18 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Necab1Q8BG18 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Necab1Q8BG18 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Necab1Q8BG18 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Necab1Q8BG18 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Necab1Q8BG18 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Necab1Q8BG18 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Necab1Q8BG18 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Necab1Q8BG18 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Necab1Q8BG18 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Necab1Q8BG18 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Necab1Q8BG18 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Necab1Q8BG18 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Necab1Q8BG18 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Necab1Q8BG18 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Necab1Q8BG18 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Necab1Q8BG18 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Necab1Q8BG18 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Necab1Q8BG18 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Necab1Q8BG18 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Necab1Q8BG18 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Necab1Q8BG18 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Necab1Q8BG18 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Necab1Q8BG18 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Necab1Q8BG18 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Necab1Q8BG18 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Necab1Q8BG18 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Necab1Q8BG18 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Necab1Q8BG18 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Necab1Q8BG18 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Necab1Q8BG18 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Necab1Q8BG18 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Necab1Q8BG18 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Necab1Q8BG18 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Necab1Q8BG18 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms