Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFT6

Jmjd4, JmjC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd4Q8BFT6 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Jmjd4Q8BFT6 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Jmjd4Q8BFT6 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Jmjd4Q8BFT6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Jmjd4Q8BFT6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Jmjd4Q8BFT6 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Jmjd4Q8BFT6 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Jmjd4Q8BFT6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Jmjd4Q8BFT6 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Jmjd4Q8BFT6 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Jmjd4Q8BFT6 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Jmjd4Q8BFT6 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Jmjd4Q8BFT6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Jmjd4Q8BFT6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Jmjd4Q8BFT6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Jmjd4Q8BFT6 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Jmjd4Q8BFT6 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Jmjd4Q8BFT6 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Jmjd4Q8BFT6 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Jmjd4Q8BFT6 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Jmjd4Q8BFT6 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Jmjd4Q8BFT6 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Jmjd4Q8BFT6 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Jmjd4Q8BFT6 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Jmjd4Q8BFT6 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Jmjd4Q8BFT6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Jmjd4Q8BFT6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Jmjd4Q8BFT6 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Jmjd4Q8BFT6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Jmjd4Q8BFT6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Jmjd4Q8BFT6 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Jmjd4Q8BFT6 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Jmjd4Q8BFT6 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Jmjd4Q8BFT6 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Jmjd4Q8BFT6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Jmjd4Q8BFT6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Jmjd4Q8BFT6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Jmjd4Q8BFT6 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Jmjd4Q8BFT6 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Jmjd4Q8BFT6 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Jmjd4Q8BFT6 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Jmjd4Q8BFT6 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Jmjd4Q8BFT6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Jmjd4Q8BFT6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Jmjd4Q8BFT6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Jmjd4Q8BFT6 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Jmjd4Q8BFT6 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Jmjd4Q8BFT6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Jmjd4Q8BFT6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Jmjd4Q8BFT6 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Jmjd4Q8BFT6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Jmjd4Q8BFT6 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Jmjd4Q8BFT6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Jmjd4Q8BFT6 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Jmjd4Q8BFT6 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Jmjd4Q8BFT6 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Jmjd4Q8BFT6 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Jmjd4Q8BFT6 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Jmjd4Q8BFT6 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Jmjd4Q8BFT6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Jmjd4Q8BFT6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Jmjd4Q8BFT6 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Jmjd4Q8BFT6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Jmjd4Q8BFT6 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Jmjd4Q8BFT6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
Jmjd4Q8BFT6 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Jmjd4Q8BFT6 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Jmjd4Q8BFT6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Jmjd4Q8BFT6 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Jmjd4Q8BFT6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Jmjd4Q8BFT6 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Jmjd4Q8BFT6 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Jmjd4Q8BFT6 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Jmjd4Q8BFT6 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Jmjd4Q8BFT6 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Jmjd4Q8BFT6 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Jmjd4Q8BFT6 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Jmjd4Q8BFT6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Jmjd4Q8BFT6 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Jmjd4Q8BFT6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Jmjd4Q8BFT6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Jmjd4Q8BFT6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Jmjd4Q8BFT6 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Jmjd4Q8BFT6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Jmjd4Q8BFT6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Jmjd4Q8BFT6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Jmjd4Q8BFT6 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Jmjd4Q8BFT6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Jmjd4Q8BFT6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Jmjd4Q8BFT6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Jmjd4Q8BFT6 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Jmjd4Q8BFT6 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Jmjd4Q8BFT6 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Jmjd4Q8BFT6 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Jmjd4Q8BFT6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Jmjd4Q8BFT6 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Jmjd4Q8BFT6 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Jmjd4Q8BFT6 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Jmjd4Q8BFT6 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Jmjd4Q8BFT6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms