Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfascQ810U3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfascQ810U3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfascQ810U3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
NfascQ810U3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NfascQ810U3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NfascQ810U3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NfascQ810U3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms