Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZF2

Ifne, Interferon epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfneQ80ZF2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IfneQ80ZF2 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms