Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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NanogQ80Z64 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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NanogQ80Z64 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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NanogQ80Z64 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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NanogQ80Z64 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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