Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kdm5bQ80Y84 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms