Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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