Protein–RNA interactions for Protein: Q80W04

Tmcc2, Transmembrane and coiled-coil domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmcc2Q80W04 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmcc2Q80W04 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.3 ms