Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC33.49■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC33.45■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC33.45■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
NischQ80TM9 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
NischQ80TM9 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
NischQ80TM9 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
NischQ80TM9 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
NischQ80TM9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
NischQ80TM9 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
NischQ80TM9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
NischQ80TM9 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
NischQ80TM9 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
NischQ80TM9 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
NischQ80TM9 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
NischQ80TM9 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
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