Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSY8

Sgo2, Shugoshin 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2Q7TSY8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sgo2Q7TSY8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms