Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
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