Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SynmQ70IV5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SynmQ70IV5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SynmQ70IV5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SynmQ70IV5 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SynmQ70IV5 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SynmQ70IV5 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SynmQ70IV5 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SynmQ70IV5 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SynmQ70IV5 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SynmQ70IV5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SynmQ70IV5 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SynmQ70IV5 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SynmQ70IV5 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SynmQ70IV5 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SynmQ70IV5 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SynmQ70IV5 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SynmQ70IV5 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SynmQ70IV5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SynmQ70IV5 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SynmQ70IV5 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SynmQ70IV5 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SynmQ70IV5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SynmQ70IV5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SynmQ70IV5 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SynmQ70IV5 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SynmQ70IV5 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SynmQ70IV5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SynmQ70IV5 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SynmQ70IV5 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
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