Protein–RNA interactions for Protein: Q704Y3

Trpv1, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 1, mousemouse

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv1Q704Y3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpv1Q704Y3 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpv1Q704Y3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpv1Q704Y3 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpv1Q704Y3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpv1Q704Y3 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpv1Q704Y3 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpv1Q704Y3 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpv1Q704Y3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpv1Q704Y3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpv1Q704Y3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpv1Q704Y3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpv1Q704Y3 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpv1Q704Y3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpv1Q704Y3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpv1Q704Y3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpv1Q704Y3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpv1Q704Y3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpv1Q704Y3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpv1Q704Y3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpv1Q704Y3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpv1Q704Y3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpv1Q704Y3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpv1Q704Y3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpv1Q704Y3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpv1Q704Y3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpv1Q704Y3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpv1Q704Y3 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpv1Q704Y3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpv1Q704Y3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpv1Q704Y3 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpv1Q704Y3 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpv1Q704Y3 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpv1Q704Y3 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpv1Q704Y3 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpv1Q704Y3 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpv1Q704Y3 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpv1Q704Y3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpv1Q704Y3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpv1Q704Y3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpv1Q704Y3 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trpv1Q704Y3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trpv1Q704Y3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trpv1Q704Y3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trpv1Q704Y3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trpv1Q704Y3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpv1Q704Y3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpv1Q704Y3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpv1Q704Y3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpv1Q704Y3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpv1Q704Y3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpv1Q704Y3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpv1Q704Y3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpv1Q704Y3 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpv1Q704Y3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpv1Q704Y3 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpv1Q704Y3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpv1Q704Y3 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpv1Q704Y3 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpv1Q704Y3 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpv1Q704Y3 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpv1Q704Y3 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpv1Q704Y3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpv1Q704Y3 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpv1Q704Y3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpv1Q704Y3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpv1Q704Y3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpv1Q704Y3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpv1Q704Y3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpv1Q704Y3 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpv1Q704Y3 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpv1Q704Y3 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpv1Q704Y3 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpv1Q704Y3 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpv1Q704Y3 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpv1Q704Y3 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpv1Q704Y3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpv1Q704Y3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpv1Q704Y3 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpv1Q704Y3 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpv1Q704Y3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpv1Q704Y3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpv1Q704Y3 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpv1Q704Y3 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpv1Q704Y3 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpv1Q704Y3 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpv1Q704Y3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpv1Q704Y3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpv1Q704Y3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpv1Q704Y3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpv1Q704Y3 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpv1Q704Y3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpv1Q704Y3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpv1Q704Y3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpv1Q704Y3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpv1Q704Y3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpv1Q704Y3 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpv1Q704Y3 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpv1Q704Y3 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpv1Q704Y3 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms