Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ncapd3Q6ZQK0 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ncapd3Q6ZQK0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ncapd3Q6ZQK0 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ncapd3Q6ZQK0 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ncapd3Q6ZQK0 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ncapd3Q6ZQK0 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ncapd3Q6ZQK0 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ncapd3Q6ZQK0 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ncapd3Q6ZQK0 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ncapd3Q6ZQK0 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ncapd3Q6ZQK0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ncapd3Q6ZQK0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ncapd3Q6ZQK0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ncapd3Q6ZQK0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ncapd3Q6ZQK0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ncapd3Q6ZQK0 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ncapd3Q6ZQK0 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ncapd3Q6ZQK0 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ncapd3Q6ZQK0 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ncapd3Q6ZQK0 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ncapd3Q6ZQK0 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ncapd3Q6ZQK0 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ncapd3Q6ZQK0 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ncapd3Q6ZQK0 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ncapd3Q6ZQK0 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ncapd3Q6ZQK0 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ncapd3Q6ZQK0 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ncapd3Q6ZQK0 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ncapd3Q6ZQK0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ncapd3Q6ZQK0 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ncapd3Q6ZQK0 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ncapd3Q6ZQK0 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ncapd3Q6ZQK0 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ncapd3Q6ZQK0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ncapd3Q6ZQK0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ncapd3Q6ZQK0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ncapd3Q6ZQK0 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ncapd3Q6ZQK0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ncapd3Q6ZQK0 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ncapd3Q6ZQK0 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ncapd3Q6ZQK0 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ncapd3Q6ZQK0 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ncapd3Q6ZQK0 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ncapd3Q6ZQK0 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ncapd3Q6ZQK0 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ncapd3Q6ZQK0 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ncapd3Q6ZQK0 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ncapd3Q6ZQK0 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ncapd3Q6ZQK0 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ncapd3Q6ZQK0 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ncapd3Q6ZQK0 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ncapd3Q6ZQK0 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ncapd3Q6ZQK0 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ncapd3Q6ZQK0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ncapd3Q6ZQK0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ncapd3Q6ZQK0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms