Protein–RNA interactions for Protein: Q6UJY2

Slc9c1, Sodium/hydrogen exchanger 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9c1Q6UJY2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc9c1Q6UJY2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc9c1Q6UJY2 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc9c1Q6UJY2 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc9c1Q6UJY2 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc9c1Q6UJY2 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc9c1Q6UJY2 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc9c1Q6UJY2 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc9c1Q6UJY2 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc9c1Q6UJY2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc9c1Q6UJY2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc9c1Q6UJY2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc9c1Q6UJY2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc9c1Q6UJY2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc9c1Q6UJY2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc9c1Q6UJY2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc9c1Q6UJY2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc9c1Q6UJY2 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc9c1Q6UJY2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc9c1Q6UJY2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc9c1Q6UJY2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc9c1Q6UJY2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc9c1Q6UJY2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc9c1Q6UJY2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc9c1Q6UJY2 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc9c1Q6UJY2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc9c1Q6UJY2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc9c1Q6UJY2 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc9c1Q6UJY2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc9c1Q6UJY2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc9c1Q6UJY2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc9c1Q6UJY2 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc9c1Q6UJY2 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc9c1Q6UJY2 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc9c1Q6UJY2 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc9c1Q6UJY2 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc9c1Q6UJY2 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc9c1Q6UJY2 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc9c1Q6UJY2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc9c1Q6UJY2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc9c1Q6UJY2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc9c1Q6UJY2 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc9c1Q6UJY2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc9c1Q6UJY2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc9c1Q6UJY2 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc9c1Q6UJY2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc9c1Q6UJY2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc9c1Q6UJY2 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc9c1Q6UJY2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc9c1Q6UJY2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc9c1Q6UJY2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc9c1Q6UJY2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc9c1Q6UJY2 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc9c1Q6UJY2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc9c1Q6UJY2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc9c1Q6UJY2 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc9c1Q6UJY2 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc9c1Q6UJY2 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc9c1Q6UJY2 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc9c1Q6UJY2 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc9c1Q6UJY2 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc9c1Q6UJY2 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc9c1Q6UJY2 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc9c1Q6UJY2 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc9c1Q6UJY2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc9c1Q6UJY2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc9c1Q6UJY2 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc9c1Q6UJY2 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc9c1Q6UJY2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc9c1Q6UJY2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc9c1Q6UJY2 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc9c1Q6UJY2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc9c1Q6UJY2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc9c1Q6UJY2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc9c1Q6UJY2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc9c1Q6UJY2 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc9c1Q6UJY2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc9c1Q6UJY2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc9c1Q6UJY2 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc9c1Q6UJY2 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc9c1Q6UJY2 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc9c1Q6UJY2 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc9c1Q6UJY2 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc9c1Q6UJY2 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc9c1Q6UJY2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc9c1Q6UJY2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc9c1Q6UJY2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc9c1Q6UJY2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc9c1Q6UJY2 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc9c1Q6UJY2 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc9c1Q6UJY2 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc9c1Q6UJY2 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc9c1Q6UJY2 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc9c1Q6UJY2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Slc9c1Q6UJY2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Slc9c1Q6UJY2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc9c1Q6UJY2 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc9c1Q6UJY2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc9c1Q6UJY2 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc9c1Q6UJY2 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms