Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5L9

Shc4, SHC-transforming protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc4Q6S5L9 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Shc4Q6S5L9 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shc4Q6S5L9 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shc4Q6S5L9 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shc4Q6S5L9 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Shc4Q6S5L9 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shc4Q6S5L9 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Shc4Q6S5L9 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shc4Q6S5L9 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shc4Q6S5L9 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shc4Q6S5L9 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shc4Q6S5L9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shc4Q6S5L9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shc4Q6S5L9 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shc4Q6S5L9 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shc4Q6S5L9 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shc4Q6S5L9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Shc4Q6S5L9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shc4Q6S5L9 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shc4Q6S5L9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shc4Q6S5L9 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Shc4Q6S5L9 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shc4Q6S5L9 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shc4Q6S5L9 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shc4Q6S5L9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shc4Q6S5L9 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shc4Q6S5L9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Shc4Q6S5L9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shc4Q6S5L9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shc4Q6S5L9 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shc4Q6S5L9 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shc4Q6S5L9 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Shc4Q6S5L9 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shc4Q6S5L9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shc4Q6S5L9 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Shc4Q6S5L9 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Shc4Q6S5L9 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Shc4Q6S5L9 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shc4Q6S5L9 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shc4Q6S5L9 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Shc4Q6S5L9 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shc4Q6S5L9 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Shc4Q6S5L9 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shc4Q6S5L9 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shc4Q6S5L9 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Shc4Q6S5L9 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Shc4Q6S5L9 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shc4Q6S5L9 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Shc4Q6S5L9 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shc4Q6S5L9 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Shc4Q6S5L9 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shc4Q6S5L9 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shc4Q6S5L9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms