Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN1

Ccdc57, Coiled-coil domain-containing protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc57Q6PHN1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc57Q6PHN1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc57Q6PHN1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc57Q6PHN1 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc57Q6PHN1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc57Q6PHN1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc57Q6PHN1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc57Q6PHN1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc57Q6PHN1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc57Q6PHN1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc57Q6PHN1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc57Q6PHN1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc57Q6PHN1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc57Q6PHN1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc57Q6PHN1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc57Q6PHN1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc57Q6PHN1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc57Q6PHN1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc57Q6PHN1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc57Q6PHN1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc57Q6PHN1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc57Q6PHN1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc57Q6PHN1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc57Q6PHN1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc57Q6PHN1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc57Q6PHN1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms