Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rad54bQ6PFE3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms