Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK0

Zbtb39, Zinc finger and BTB domain-containing 39, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb39Q6PDK0 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zbtb39Q6PDK0 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zbtb39Q6PDK0 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zbtb39Q6PDK0 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zbtb39Q6PDK0 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zbtb39Q6PDK0 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zbtb39Q6PDK0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zbtb39Q6PDK0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zbtb39Q6PDK0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zbtb39Q6PDK0 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Zbtb39Q6PDK0 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zbtb39Q6PDK0 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zbtb39Q6PDK0 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zbtb39Q6PDK0 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zbtb39Q6PDK0 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zbtb39Q6PDK0 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Zbtb39Q6PDK0 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zbtb39Q6PDK0 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zbtb39Q6PDK0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zbtb39Q6PDK0 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Zbtb39Q6PDK0 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Zbtb39Q6PDK0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Zbtb39Q6PDK0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Zbtb39Q6PDK0 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zbtb39Q6PDK0 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zbtb39Q6PDK0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zbtb39Q6PDK0 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zbtb39Q6PDK0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zbtb39Q6PDK0 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zbtb39Q6PDK0 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zbtb39Q6PDK0 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zbtb39Q6PDK0 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Zbtb39Q6PDK0 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zbtb39Q6PDK0 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zbtb39Q6PDK0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zbtb39Q6PDK0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zbtb39Q6PDK0 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zbtb39Q6PDK0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zbtb39Q6PDK0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zbtb39Q6PDK0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zbtb39Q6PDK0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zbtb39Q6PDK0 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zbtb39Q6PDK0 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zbtb39Q6PDK0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zbtb39Q6PDK0 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zbtb39Q6PDK0 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zbtb39Q6PDK0 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zbtb39Q6PDK0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zbtb39Q6PDK0 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zbtb39Q6PDK0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zbtb39Q6PDK0 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Zbtb39Q6PDK0 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zbtb39Q6PDK0 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zbtb39Q6PDK0 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zbtb39Q6PDK0 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zbtb39Q6PDK0 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zbtb39Q6PDK0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zbtb39Q6PDK0 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zbtb39Q6PDK0 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zbtb39Q6PDK0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zbtb39Q6PDK0 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zbtb39Q6PDK0 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zbtb39Q6PDK0 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zbtb39Q6PDK0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zbtb39Q6PDK0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zbtb39Q6PDK0 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zbtb39Q6PDK0 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zbtb39Q6PDK0 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zbtb39Q6PDK0 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zbtb39Q6PDK0 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zbtb39Q6PDK0 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zbtb39Q6PDK0 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Zbtb39Q6PDK0 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zbtb39Q6PDK0 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zbtb39Q6PDK0 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zbtb39Q6PDK0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zbtb39Q6PDK0 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zbtb39Q6PDK0 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zbtb39Q6PDK0 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zbtb39Q6PDK0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zbtb39Q6PDK0 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zbtb39Q6PDK0 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zbtb39Q6PDK0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zbtb39Q6PDK0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zbtb39Q6PDK0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zbtb39Q6PDK0 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zbtb39Q6PDK0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zbtb39Q6PDK0 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zbtb39Q6PDK0 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zbtb39Q6PDK0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zbtb39Q6PDK0 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Zbtb39Q6PDK0 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Zbtb39Q6PDK0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zbtb39Q6PDK0 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zbtb39Q6PDK0 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zbtb39Q6PDK0 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zbtb39Q6PDK0 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zbtb39Q6PDK0 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zbtb39Q6PDK0 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zbtb39Q6PDK0 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms