Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8N9

Cyp2d40, Cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 40, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2d40Q6P8N9 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms