Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2L7

Casc4, Protein CASC4, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc4Q6P2L7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casc4Q6P2L7 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms