Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PrimpolQ6P1E7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PrimpolQ6P1E7 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PrimpolQ6P1E7 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PrimpolQ6P1E7 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PrimpolQ6P1E7 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PrimpolQ6P1E7 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PrimpolQ6P1E7 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PrimpolQ6P1E7 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PrimpolQ6P1E7 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PrimpolQ6P1E7 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PrimpolQ6P1E7 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PrimpolQ6P1E7 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PrimpolQ6P1E7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PrimpolQ6P1E7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PrimpolQ6P1E7 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PrimpolQ6P1E7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PrimpolQ6P1E7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PrimpolQ6P1E7 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PrimpolQ6P1E7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PrimpolQ6P1E7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PrimpolQ6P1E7 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PrimpolQ6P1E7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PrimpolQ6P1E7 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PrimpolQ6P1E7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PrimpolQ6P1E7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PrimpolQ6P1E7 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PrimpolQ6P1E7 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PrimpolQ6P1E7 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PrimpolQ6P1E7 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PrimpolQ6P1E7 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PrimpolQ6P1E7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PrimpolQ6P1E7 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PrimpolQ6P1E7 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PrimpolQ6P1E7 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PrimpolQ6P1E7 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PrimpolQ6P1E7 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PrimpolQ6P1E7 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PrimpolQ6P1E7 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PrimpolQ6P1E7 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PrimpolQ6P1E7 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PrimpolQ6P1E7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PrimpolQ6P1E7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PrimpolQ6P1E7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PrimpolQ6P1E7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PrimpolQ6P1E7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PrimpolQ6P1E7 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PrimpolQ6P1E7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PrimpolQ6P1E7 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PrimpolQ6P1E7 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PrimpolQ6P1E7 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PrimpolQ6P1E7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PrimpolQ6P1E7 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PrimpolQ6P1E7 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PrimpolQ6P1E7 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PrimpolQ6P1E7 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PrimpolQ6P1E7 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PrimpolQ6P1E7 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PrimpolQ6P1E7 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PrimpolQ6P1E7 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PrimpolQ6P1E7 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PrimpolQ6P1E7 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PrimpolQ6P1E7 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PrimpolQ6P1E7 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PrimpolQ6P1E7 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PrimpolQ6P1E7 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PrimpolQ6P1E7 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PrimpolQ6P1E7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PrimpolQ6P1E7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PrimpolQ6P1E7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PrimpolQ6P1E7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PrimpolQ6P1E7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PrimpolQ6P1E7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PrimpolQ6P1E7 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PrimpolQ6P1E7 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PrimpolQ6P1E7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PrimpolQ6P1E7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PrimpolQ6P1E7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PrimpolQ6P1E7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PrimpolQ6P1E7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PrimpolQ6P1E7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PrimpolQ6P1E7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PrimpolQ6P1E7 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PrimpolQ6P1E7 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PrimpolQ6P1E7 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PrimpolQ6P1E7 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PrimpolQ6P1E7 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PrimpolQ6P1E7 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PrimpolQ6P1E7 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PrimpolQ6P1E7 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PrimpolQ6P1E7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PrimpolQ6P1E7 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PrimpolQ6P1E7 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PrimpolQ6P1E7 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PrimpolQ6P1E7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PrimpolQ6P1E7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PrimpolQ6P1E7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PrimpolQ6P1E7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PrimpolQ6P1E7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PrimpolQ6P1E7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms