Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms