Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Soga3Q6NZL0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Soga3Q6NZL0 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Soga3Q6NZL0 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Soga3Q6NZL0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Soga3Q6NZL0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Soga3Q6NZL0 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Soga3Q6NZL0 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Soga3Q6NZL0 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Soga3Q6NZL0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Soga3Q6NZL0 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Soga3Q6NZL0 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Soga3Q6NZL0 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Soga3Q6NZL0 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Soga3Q6NZL0 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Soga3Q6NZL0 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Soga3Q6NZL0 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Soga3Q6NZL0 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Soga3Q6NZL0 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Soga3Q6NZL0 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Soga3Q6NZL0 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Soga3Q6NZL0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Soga3Q6NZL0 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Soga3Q6NZL0 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Soga3Q6NZL0 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Soga3Q6NZL0 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Soga3Q6NZL0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Soga3Q6NZL0 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Soga3Q6NZL0 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Soga3Q6NZL0 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Soga3Q6NZL0 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Soga3Q6NZL0 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Soga3Q6NZL0 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Soga3Q6NZL0 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Soga3Q6NZL0 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Soga3Q6NZL0 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Soga3Q6NZL0 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Soga3Q6NZL0 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Soga3Q6NZL0 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Soga3Q6NZL0 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Soga3Q6NZL0 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Soga3Q6NZL0 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Soga3Q6NZL0 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Soga3Q6NZL0 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Soga3Q6NZL0 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Soga3Q6NZL0 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Soga3Q6NZL0 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Soga3Q6NZL0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Soga3Q6NZL0 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Soga3Q6NZL0 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Soga3Q6NZL0 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Soga3Q6NZL0 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Soga3Q6NZL0 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Soga3Q6NZL0 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Soga3Q6NZL0 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Soga3Q6NZL0 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Soga3Q6NZL0 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Soga3Q6NZL0 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Soga3Q6NZL0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Soga3Q6NZL0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Soga3Q6NZL0 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Soga3Q6NZL0 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Soga3Q6NZL0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Soga3Q6NZL0 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Soga3Q6NZL0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Soga3Q6NZL0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Soga3Q6NZL0 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Soga3Q6NZL0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Soga3Q6NZL0 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Soga3Q6NZL0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Soga3Q6NZL0 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Soga3Q6NZL0 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms