Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXM2

Rcbtb1, RCC1 and BTB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb1Q6NXM2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcbtb1Q6NXM2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcbtb1Q6NXM2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms