Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms