Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVD0

Frem2, FRAS1-related extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frem2Q6NVD0 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Frem2Q6NVD0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Frem2Q6NVD0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Frem2Q6NVD0 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Frem2Q6NVD0 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Frem2Q6NVD0 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Frem2Q6NVD0 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Frem2Q6NVD0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Frem2Q6NVD0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Frem2Q6NVD0 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Frem2Q6NVD0 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Frem2Q6NVD0 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Frem2Q6NVD0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Frem2Q6NVD0 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Frem2Q6NVD0 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Frem2Q6NVD0 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Frem2Q6NVD0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Frem2Q6NVD0 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Frem2Q6NVD0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Frem2Q6NVD0 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Frem2Q6NVD0 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Frem2Q6NVD0 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Frem2Q6NVD0 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Frem2Q6NVD0 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Frem2Q6NVD0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Frem2Q6NVD0 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Frem2Q6NVD0 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Frem2Q6NVD0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Frem2Q6NVD0 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Frem2Q6NVD0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Frem2Q6NVD0 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Frem2Q6NVD0 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Frem2Q6NVD0 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Frem2Q6NVD0 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Frem2Q6NVD0 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Frem2Q6NVD0 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Frem2Q6NVD0 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Frem2Q6NVD0 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Frem2Q6NVD0 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Frem2Q6NVD0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Frem2Q6NVD0 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Frem2Q6NVD0 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Frem2Q6NVD0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Frem2Q6NVD0 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Frem2Q6NVD0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Frem2Q6NVD0 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Frem2Q6NVD0 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Frem2Q6NVD0 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Frem2Q6NVD0 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Frem2Q6NVD0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Frem2Q6NVD0 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Frem2Q6NVD0 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Frem2Q6NVD0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Frem2Q6NVD0 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Frem2Q6NVD0 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Frem2Q6NVD0 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Frem2Q6NVD0 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Frem2Q6NVD0 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Frem2Q6NVD0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Frem2Q6NVD0 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Frem2Q6NVD0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Frem2Q6NVD0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Frem2Q6NVD0 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Frem2Q6NVD0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Frem2Q6NVD0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Frem2Q6NVD0 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Frem2Q6NVD0 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Frem2Q6NVD0 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Frem2Q6NVD0 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Frem2Q6NVD0 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Frem2Q6NVD0 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Frem2Q6NVD0 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Frem2Q6NVD0 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Frem2Q6NVD0 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Frem2Q6NVD0 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frem2Q6NVD0 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frem2Q6NVD0 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Frem2Q6NVD0 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frem2Q6NVD0 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frem2Q6NVD0 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frem2Q6NVD0 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frem2Q6NVD0 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Frem2Q6NVD0 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frem2Q6NVD0 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frem2Q6NVD0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frem2Q6NVD0 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frem2Q6NVD0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frem2Q6NVD0 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frem2Q6NVD0 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frem2Q6NVD0 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frem2Q6NVD0 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frem2Q6NVD0 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frem2Q6NVD0 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frem2Q6NVD0 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frem2Q6NVD0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frem2Q6NVD0 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frem2Q6NVD0 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frem2Q6NVD0 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frem2Q6NVD0 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frem2Q6NVD0 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms