Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SphkapQ6NSW3 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SphkapQ6NSW3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms