Protein–RNA interactions for Protein: Q6IME9

Krt72, Keratin, type II cytoskeletal 72, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt72Q6IME9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt72Q6IME9 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms