Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms