Protein–RNA interactions for Protein: Q6EDY6

Carmil1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil1Q6EDY6 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Carmil1Q6EDY6 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Carmil1Q6EDY6 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Carmil1Q6EDY6 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Carmil1Q6EDY6 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Carmil1Q6EDY6 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Carmil1Q6EDY6 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Carmil1Q6EDY6 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Carmil1Q6EDY6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Carmil1Q6EDY6 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Carmil1Q6EDY6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Carmil1Q6EDY6 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Carmil1Q6EDY6 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Carmil1Q6EDY6 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Carmil1Q6EDY6 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Carmil1Q6EDY6 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Carmil1Q6EDY6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Carmil1Q6EDY6 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Carmil1Q6EDY6 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Carmil1Q6EDY6 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Carmil1Q6EDY6 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Carmil1Q6EDY6 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Carmil1Q6EDY6 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Carmil1Q6EDY6 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Carmil1Q6EDY6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Carmil1Q6EDY6 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Carmil1Q6EDY6 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Carmil1Q6EDY6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Carmil1Q6EDY6 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Carmil1Q6EDY6 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Carmil1Q6EDY6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Carmil1Q6EDY6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Carmil1Q6EDY6 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Carmil1Q6EDY6 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Carmil1Q6EDY6 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Carmil1Q6EDY6 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Carmil1Q6EDY6 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Carmil1Q6EDY6 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Carmil1Q6EDY6 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Carmil1Q6EDY6 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Carmil1Q6EDY6 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Carmil1Q6EDY6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Carmil1Q6EDY6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Carmil1Q6EDY6 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Carmil1Q6EDY6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Carmil1Q6EDY6 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Carmil1Q6EDY6 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Carmil1Q6EDY6 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Carmil1Q6EDY6 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Carmil1Q6EDY6 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Carmil1Q6EDY6 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Carmil1Q6EDY6 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Carmil1Q6EDY6 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Carmil1Q6EDY6 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Carmil1Q6EDY6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Carmil1Q6EDY6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Carmil1Q6EDY6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Carmil1Q6EDY6 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Carmil1Q6EDY6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Carmil1Q6EDY6 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Carmil1Q6EDY6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Carmil1Q6EDY6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Carmil1Q6EDY6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Carmil1Q6EDY6 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Carmil1Q6EDY6 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Carmil1Q6EDY6 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Carmil1Q6EDY6 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Carmil1Q6EDY6 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Carmil1Q6EDY6 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Carmil1Q6EDY6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Carmil1Q6EDY6 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Carmil1Q6EDY6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Carmil1Q6EDY6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Carmil1Q6EDY6 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Carmil1Q6EDY6 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Carmil1Q6EDY6 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms