Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Cep290Q6A078 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Cep290Q6A078 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Cep290Q6A078 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Cep290Q6A078 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Cep290Q6A078 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Cep290Q6A078 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Cep290Q6A078 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cep290Q6A078 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cep290Q6A078 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cep290Q6A078 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cep290Q6A078 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Cep290Q6A078 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cep290Q6A078 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cep290Q6A078 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cep290Q6A078 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cep290Q6A078 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cep290Q6A078 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cep290Q6A078 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cep290Q6A078 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cep290Q6A078 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cep290Q6A078 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cep290Q6A078 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cep290Q6A078 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cep290Q6A078 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cep290Q6A078 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cep290Q6A078 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cep290Q6A078 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cep290Q6A078 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cep290Q6A078 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cep290Q6A078 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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