Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZZ6

Tmcc1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmcc1Q69ZZ6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmcc1Q69ZZ6 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms