Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sbno1Q689Z5 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms