Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms