Protein–RNA interactions for Protein: Q62442

Vamp1, Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1Q62442 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Vamp1Q62442 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vamp1Q62442 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vamp1Q62442 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vamp1Q62442 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vamp1Q62442 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vamp1Q62442 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vamp1Q62442 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vamp1Q62442 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vamp1Q62442 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vamp1Q62442 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vamp1Q62442 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vamp1Q62442 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vamp1Q62442 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Vamp1Q62442 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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Vamp1Q62442 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vamp1Q62442 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vamp1Q62442 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vamp1Q62442 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vamp1Q62442 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vamp1Q62442 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vamp1Q62442 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vamp1Q62442 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vamp1Q62442 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vamp1Q62442 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vamp1Q62442 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vamp1Q62442 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vamp1Q62442 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vamp1Q62442 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vamp1Q62442 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Vamp1Q62442 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vamp1Q62442 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
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Vamp1Q62442 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Vamp1Q62442 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vamp1Q62442 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vamp1Q62442 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vamp1Q62442 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vamp1Q62442 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vamp1Q62442 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Vamp1Q62442 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vamp1Q62442 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vamp1Q62442 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Vamp1Q62442 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Vamp1Q62442 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Vamp1Q62442 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vamp1Q62442 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vamp1Q62442 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vamp1Q62442 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vamp1Q62442 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vamp1Q62442 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vamp1Q62442 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vamp1Q62442 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vamp1Q62442 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vamp1Q62442 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vamp1Q62442 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vamp1Q62442 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vamp1Q62442 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vamp1Q62442 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Vamp1Q62442 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vamp1Q62442 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vamp1Q62442 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vamp1Q62442 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vamp1Q62442 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vamp1Q62442 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vamp1Q62442 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vamp1Q62442 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vamp1Q62442 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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