Protein–RNA interactions for Protein: Q62407

Speg, Striated muscle-specific serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 3,262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpegQ62407 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SpegQ62407 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SpegQ62407 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SpegQ62407 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SpegQ62407 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SpegQ62407 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SpegQ62407 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SpegQ62407 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SpegQ62407 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SpegQ62407 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SpegQ62407 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SpegQ62407 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SpegQ62407 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SpegQ62407 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SpegQ62407 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SpegQ62407 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SpegQ62407 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SpegQ62407 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SpegQ62407 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SpegQ62407 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SpegQ62407 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SpegQ62407 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SpegQ62407 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SpegQ62407 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SpegQ62407 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SpegQ62407 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SpegQ62407 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SpegQ62407 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SpegQ62407 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SpegQ62407 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SpegQ62407 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SpegQ62407 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SpegQ62407 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SpegQ62407 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SpegQ62407 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SpegQ62407 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SpegQ62407 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SpegQ62407 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SpegQ62407 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SpegQ62407 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SpegQ62407 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SpegQ62407 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SpegQ62407 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SpegQ62407 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SpegQ62407 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SpegQ62407 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SpegQ62407 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SpegQ62407 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SpegQ62407 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SpegQ62407 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SpegQ62407 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SpegQ62407 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SpegQ62407 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SpegQ62407 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SpegQ62407 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SpegQ62407 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SpegQ62407 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SpegQ62407 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SpegQ62407 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SpegQ62407 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SpegQ62407 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SpegQ62407 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SpegQ62407 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SpegQ62407 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SpegQ62407 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SpegQ62407 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SpegQ62407 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SpegQ62407 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SpegQ62407 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SpegQ62407 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SpegQ62407 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SpegQ62407 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SpegQ62407 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SpegQ62407 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SpegQ62407 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SpegQ62407 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SpegQ62407 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SpegQ62407 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SpegQ62407 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SpegQ62407 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SpegQ62407 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SpegQ62407 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SpegQ62407 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SpegQ62407 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SpegQ62407 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SpegQ62407 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SpegQ62407 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SpegQ62407 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SpegQ62407 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SpegQ62407 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SpegQ62407 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SpegQ62407 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SpegQ62407 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SpegQ62407 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SpegQ62407 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SpegQ62407 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SpegQ62407 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SpegQ62407 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SpegQ62407 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SpegQ62407 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms