Protein–RNA interactions for Protein: Q62383

Supt6h, Transcription elongation factor SPT6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt6hQ62383 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Supt6hQ62383 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Supt6hQ62383 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Supt6hQ62383 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Supt6hQ62383 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Supt6hQ62383 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Supt6hQ62383 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Supt6hQ62383 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Supt6hQ62383 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Supt6hQ62383 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Supt6hQ62383 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Supt6hQ62383 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Supt6hQ62383 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Supt6hQ62383 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Supt6hQ62383 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Supt6hQ62383 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Supt6hQ62383 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Supt6hQ62383 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Supt6hQ62383 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms