Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Ss18Q62280 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Ss18Q62280 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Ss18Q62280 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Ss18Q62280 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Ss18Q62280 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Ss18Q62280 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Ss18Q62280 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Ss18Q62280 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Ss18Q62280 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Ss18Q62280 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Ss18Q62280 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Ss18Q62280 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ss18Q62280 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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