Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sycp1Q62209 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms