Protein–RNA interactions for Protein: Q62132

Ptprr, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprrQ62132 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PtprrQ62132 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PtprrQ62132 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PtprrQ62132 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PtprrQ62132 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PtprrQ62132 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PtprrQ62132 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprrQ62132 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprrQ62132 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprrQ62132 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprrQ62132 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprrQ62132 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprrQ62132 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprrQ62132 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprrQ62132 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprrQ62132 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprrQ62132 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprrQ62132 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprrQ62132 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprrQ62132 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprrQ62132 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprrQ62132 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprrQ62132 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprrQ62132 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms