Protein–RNA interactions for Protein: Q61508

Ecm1, Extracellular matrix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm1Q61508 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ecm1Q61508 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ecm1Q61508 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ecm1Q61508 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ecm1Q61508 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ecm1Q61508 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ecm1Q61508 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ecm1Q61508 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ecm1Q61508 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ecm1Q61508 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ecm1Q61508 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ecm1Q61508 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ecm1Q61508 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ecm1Q61508 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ecm1Q61508 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ecm1Q61508 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ecm1Q61508 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ecm1Q61508 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ecm1Q61508 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ecm1Q61508 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ecm1Q61508 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ecm1Q61508 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ecm1Q61508 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ecm1Q61508 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ecm1Q61508 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ecm1Q61508 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ecm1Q61508 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ecm1Q61508 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ecm1Q61508 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ecm1Q61508 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ecm1Q61508 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ecm1Q61508 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ecm1Q61508 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ecm1Q61508 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ecm1Q61508 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ecm1Q61508 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ecm1Q61508 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ecm1Q61508 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ecm1Q61508 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ecm1Q61508 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ecm1Q61508 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ecm1Q61508 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ecm1Q61508 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ecm1Q61508 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ecm1Q61508 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ecm1Q61508 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ecm1Q61508 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ecm1Q61508 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ecm1Q61508 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ecm1Q61508 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ecm1Q61508 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ecm1Q61508 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ecm1Q61508 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ecm1Q61508 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ecm1Q61508 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ecm1Q61508 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ecm1Q61508 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ecm1Q61508 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ecm1Q61508 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ecm1Q61508 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ecm1Q61508 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ecm1Q61508 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ecm1Q61508 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ecm1Q61508 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ecm1Q61508 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ecm1Q61508 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ecm1Q61508 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ecm1Q61508 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ecm1Q61508 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ecm1Q61508 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ecm1Q61508 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ecm1Q61508 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ecm1Q61508 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ecm1Q61508 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ecm1Q61508 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ecm1Q61508 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ecm1Q61508 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ecm1Q61508 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ecm1Q61508 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ecm1Q61508 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ecm1Q61508 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ecm1Q61508 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ecm1Q61508 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ecm1Q61508 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ecm1Q61508 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ecm1Q61508 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ecm1Q61508 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ecm1Q61508 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ecm1Q61508 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ecm1Q61508 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ecm1Q61508 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ecm1Q61508 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ecm1Q61508 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ecm1Q61508 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ecm1Q61508 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ecm1Q61508 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ecm1Q61508 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ecm1Q61508 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ecm1Q61508 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ecm1Q61508 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms