Protein–RNA interactions for Protein: Q61412

Vsx2, Visual system homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx2Q61412 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms