Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Foxd1Q61345 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Foxd1Q61345 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Foxd1Q61345 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Foxd1Q61345 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Foxd1Q61345 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Foxd1Q61345 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Foxd1Q61345 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Foxd1Q61345 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Foxd1Q61345 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Foxd1Q61345 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Foxd1Q61345 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Foxd1Q61345 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Foxd1Q61345 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Foxd1Q61345 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Foxd1Q61345 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Foxd1Q61345 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Foxd1Q61345 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Foxd1Q61345 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Foxd1Q61345 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Foxd1Q61345 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Foxd1Q61345 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Foxd1Q61345 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Foxd1Q61345 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Foxd1Q61345 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Foxd1Q61345 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Foxd1Q61345 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Foxd1Q61345 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Foxd1Q61345 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Foxd1Q61345 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Foxd1Q61345 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Foxd1Q61345 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Foxd1Q61345 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Foxd1Q61345 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Foxd1Q61345 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Foxd1Q61345 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Foxd1Q61345 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Foxd1Q61345 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Foxd1Q61345 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Foxd1Q61345 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Foxd1Q61345 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Foxd1Q61345 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Foxd1Q61345 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Foxd1Q61345 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Foxd1Q61345 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Foxd1Q61345 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Foxd1Q61345 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Foxd1Q61345 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Foxd1Q61345 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Foxd1Q61345 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Foxd1Q61345 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Foxd1Q61345 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Foxd1Q61345 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Foxd1Q61345 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Foxd1Q61345 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Foxd1Q61345 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Foxd1Q61345 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Foxd1Q61345 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Foxd1Q61345 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxd1Q61345 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxd1Q61345 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxd1Q61345 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxd1Q61345 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxd1Q61345 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxd1Q61345 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxd1Q61345 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxd1Q61345 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxd1Q61345 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxd1Q61345 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxd1Q61345 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxd1Q61345 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxd1Q61345 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxd1Q61345 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxd1Q61345 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxd1Q61345 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxd1Q61345 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxd1Q61345 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxd1Q61345 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Foxd1Q61345 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Foxd1Q61345 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Foxd1Q61345 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Foxd1Q61345 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Foxd1Q61345 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Foxd1Q61345 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Foxd1Q61345 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Foxd1Q61345 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Foxd1Q61345 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Foxd1Q61345 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Foxd1Q61345 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Foxd1Q61345 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Foxd1Q61345 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Foxd1Q61345 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Foxd1Q61345 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Foxd1Q61345 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Foxd1Q61345 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Foxd1Q61345 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Foxd1Q61345 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Foxd1Q61345 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Foxd1Q61345 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Foxd1Q61345 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms