Protein–RNA interactions for Protein: Q61165

Slc9a1, Sodium/hydrogen exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a1Q61165 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms