Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf8Q60846 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms