Protein–RNA interactions for Protein: Q60750

Epha1, Ephrin type-A receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha1Q60750 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Epha1Q60750 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Epha1Q60750 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Epha1Q60750 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Epha1Q60750 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Epha1Q60750 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Epha1Q60750 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Epha1Q60750 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Epha1Q60750 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Epha1Q60750 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Epha1Q60750 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Epha1Q60750 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Epha1Q60750 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Epha1Q60750 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Epha1Q60750 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Epha1Q60750 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Epha1Q60750 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Epha1Q60750 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Epha1Q60750 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Epha1Q60750 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Epha1Q60750 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Epha1Q60750 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Epha1Q60750 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Epha1Q60750 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Epha1Q60750 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Epha1Q60750 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Epha1Q60750 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Epha1Q60750 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Epha1Q60750 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Epha1Q60750 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Epha1Q60750 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Epha1Q60750 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Epha1Q60750 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Epha1Q60750 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Epha1Q60750 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Epha1Q60750 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Epha1Q60750 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Epha1Q60750 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Epha1Q60750 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Epha1Q60750 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Epha1Q60750 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Epha1Q60750 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Epha1Q60750 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Epha1Q60750 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Epha1Q60750 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Epha1Q60750 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Epha1Q60750 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Epha1Q60750 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Epha1Q60750 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Epha1Q60750 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Epha1Q60750 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Epha1Q60750 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Epha1Q60750 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Epha1Q60750 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Epha1Q60750 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Epha1Q60750 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Epha1Q60750 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Epha1Q60750 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Epha1Q60750 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Epha1Q60750 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Epha1Q60750 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Epha1Q60750 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Epha1Q60750 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Epha1Q60750 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Epha1Q60750 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Epha1Q60750 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Epha1Q60750 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Epha1Q60750 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Epha1Q60750 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Epha1Q60750 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Epha1Q60750 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Epha1Q60750 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Epha1Q60750 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Epha1Q60750 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Epha1Q60750 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Epha1Q60750 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Epha1Q60750 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Epha1Q60750 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Epha1Q60750 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Epha1Q60750 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Epha1Q60750 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Epha1Q60750 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Epha1Q60750 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Epha1Q60750 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Epha1Q60750 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Epha1Q60750 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Epha1Q60750 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Epha1Q60750 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Epha1Q60750 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Epha1Q60750 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Epha1Q60750 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Epha1Q60750 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Epha1Q60750 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Epha1Q60750 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Epha1Q60750 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Epha1Q60750 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Epha1Q60750 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Epha1Q60750 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Epha1Q60750 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Epha1Q60750 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms